Кошки являются очень чистоплотными животными. Они умываются, вылизывая свою шерсть, не менее десяти раз за день; их слюна является эффективным чистящим средством. Чистоплотность является инстинктивной у всех кошачьих: чистота тела необходима при охоте, чтобы жертва не могла учуять затаившегося хищника. Кошки часто любят вылизывать своих сородичей и человека, однако компоненты их слюны вызывают у некоторых людей аллергию. При вылизывании кошки расходуют примерно столько же влаги, сколько при мочеиспускании. Многие кошки часто отрыгивают трихобезоар — шерсть, скопившуюся в желудке в результате вылизывания. Длинношёрстные кошки более подвержены этому, чем короткошёрстные. Профилактика образования трихобезоаров состоит в кормлении кошки специальными кормами и лекарствами, способствующими выведению шерсти из желудка через дефекацию.

Кошки всегда закапывают свой кал и мочу после дефекации. В природе они выбирают для этого укромные места с мягким грунтом, например песком. В многоквартирной застройке используются специальные подносы с сыпучим наполнением, выполняющие роль туалета. Кошачьи туалеты необходимо выливать и чистить каждый день, в противном случае они могут стать источником токсоплазмоза, к которому особенно восприимчивы беременные женщины и люди с ослабленным иммунитетом.

Кошки всегда ухаживают за своими когтями. В обычных условиях слишком длинные когти стачиваются при лазании по деревьям и от бега, а затем верхний, старый отмерший роговой слой снимается с когтя в виде пустой оболочки. В неволе кошка точит когти о подручные предметы. В некоторых случаях когти у кошек необходимо стричь, но при этом важно не задеть пульпу — кровеносный сосуд, доходящий практически до кончика когтя.

При определенных условиях, если ветеринарный врач сочтет это благом для животного, он может порекомендовать провести удаление когтей у кошек - онихэктомию или oneрацию по подрезанию сухожилия пальцевого сгибателя, который является своеобразным механизмом для втягивания и выпускания когтей, — тендонэктомию. Это достаточно сложные хирургические операции. В результате первой ампутируется целая концевая фаланга пальцев вместе с когтями. А во втором случае проводится вырезание небольшого участка сухожилия, что приводит к тому, что кошка не может выпускать когти, при этом после операции сустав перестает нормально двигаться, что также причиняет животному боль и дискомфорт. Процесс заживления сухожилия достаточно длителен, осложнения также не исключены. Решившиеся на эту операцию владельцы вынуждены в дальнейшем регулярно подстригать кошке отросшие когти, так как после этой операции она не в состоянии самостоятельно ухаживать за ними. Многие люди считают обе эти операции проявлением жестокости. Обе операции делаются под наркозом и часто приводят к осложнениям: в том числе к инфекциям, требующим длительного лечения и сопровождающимся сильными болями в лапах. Только молодые кошки могут легко пережить онихэктомию: удалять когти у взрослых особей опасно. В 2006 г. Департамент сельского хозяйства США ввел запрет на онихэктомию всех животных, включая как диких, так и домашних. Обе операции редко проводятся за пределами США. В Германии и Швейцарии ампутация когтей у кошек запрещена законом, а во многих других европейских странах она также запрещена в рамках Европейской конвенции по защите прав домашних животных. Против ампутации когтей выступают многие организации по защите прав животных. Согласно правилам всех международных фелинологических организаций кошки с удалёнными когтями не допускаются к участию в выставках кошек.

Аллергия на ферменты, содержащиеся в кошачьей слюне, является наиболее распространённой причиной, по которой люди не могут сосуществовать с кошкой. Некоторые люди-аллергики принимают специальные лекарства и часто моют своих кошек, т. к. еженедельное купание уничтожает более 90 % кошачьих аллергенов в доме. Были также выведены и в сентябре 2006 года поступили в продажу кошки, не вызывающие аллергической реакции у человека. Стоимость такого котёнка составляла от 6950 до 37000 долларов США. Вместе с тем, к заявлениям о том, что такие кошки могут быть выведены, следует относиться с осторожностью. Кампания Lifestyle Pets, которая занималась продажей таких котят, заявила, что 1 января 2010 г. прекратит свою деятельность.